Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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