Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ARPP21-217ENST00000436702 561 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AL359918.2-201ENST00000412311 497 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 WDYHV1-201ENST00000287387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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