Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DMDP11532 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DMDP11532 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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