Protein–RNA interactions for Protein: P0CG08

GPR89B, Golgi pH regulator B, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR89BP0CG08 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPR89BP0CG08 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms