Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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