Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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PTPRCP08575 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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