Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GJB1P08034 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
GJB1P08034 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB1P08034 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB1P08034 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms