Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLK3P07288 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms