Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TBX18O95935 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TBX18O95935 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TBX18O95935 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TBX18O95935 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TBX18O95935 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TBX18O95935 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TBX18O95935 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TBX18O95935 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TBX18O95935 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TBX18O95935 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TBX18O95935 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TBX18O95935 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TBX18O95935 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TBX18O95935 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TBX18O95935 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TBX18O95935 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TBX18O95935 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TBX18O95935 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TBX18O95935 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TBX18O95935 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TBX18O95935 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TBX18O95935 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TBX18O95935 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TBX18O95935 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TBX18O95935 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TBX18O95935 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TBX18O95935 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TBX18O95935 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TBX18O95935 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TBX18O95935 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TBX18O95935 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TBX18O95935 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TBX18O95935 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TBX18O95935 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TBX18O95935 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TBX18O95935 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TBX18O95935 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TBX18O95935 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TBX18O95935 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TBX18O95935 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TBX18O95935 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms