Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms