Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX3O95343 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX3O95343 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX3O95343 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX3O95343 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX3O95343 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX3O95343 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX3O95343 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX3O95343 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX3O95343 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX3O95343 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX3O95343 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX3O95343 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX3O95343 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX3O95343 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX3O95343 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX3O95343 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX3O95343 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX3O95343 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX3O95343 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX3O95343 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX3O95343 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms