Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNSO60931 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNSO60931 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNSO60931 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNSO60931 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNSO60931 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNSO60931 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNSO60931 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTNSO60931 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTNSO60931 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTNSO60931 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNSO60931 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms