Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1GO43497 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms