Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNMO15061 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SYNMO15061 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
SYNMO15061 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNMO15061 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms