Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms