Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf172C9J069 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf172C9J069 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf172C9J069 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf172C9J069 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf172C9J069 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf172C9J069 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf172C9J069 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf172C9J069 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf172C9J069 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf172C9J069 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf172C9J069 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf172C9J069 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms