Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms