Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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ARL2-SNX15V9GYD0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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ARL2-SNX15V9GYD0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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ARL2-SNX15V9GYD0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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ARL2-SNX15V9GYD0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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ARL2-SNX15V9GYD0 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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