Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms