Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GIT1Q9Y2X7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms