Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms