Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms