Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms