Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms