Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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COPS7AQ9UBW8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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