Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms