Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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