Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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