Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms