Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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