Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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BPESC1Q9GZL8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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