Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms