Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms