Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms