Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL7Q96S82 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms