Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CICQ96RK0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms