Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT1Q96EB6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms