Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELP4Q96EB1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms