Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG2BQ96BY7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms