Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms