Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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USP9XQ93008 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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