Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG68

TTL, Tubulin--tyrosine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLQ8NG68 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLQ8NG68 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLQ8NG68 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLQ8NG68 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TTLQ8NG68 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTLQ8NG68 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTLQ8NG68 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTLQ8NG68 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTLQ8NG68 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTLQ8NG68 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTLQ8NG68 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTLQ8NG68 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTLQ8NG68 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTLQ8NG68 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTLQ8NG68 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms