Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU4

FDCSP, Follicular dendritic cell secreted peptide, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDCSPQ8NFU4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms