Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
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ZNF548Q8NEK5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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ZNF548Q8NEK5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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ZNF548Q8NEK5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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ZNF548Q8NEK5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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