Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.1 ms