Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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C9orf40Q8IXQ3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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