Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV5

PRAG1, Tyrosine-protein kinase PRAG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAG1Q86YV5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAG1Q86YV5 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAG1Q86YV5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms