Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms