Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms