Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HECW1Q76N89 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HECW1Q76N89 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms